Il occupe les espaces du préexistant couvent dominicain que Michelozzo reconstruit de 1436 à 1446 sur commande de Cosimo il Vecchio de' Medici, avec les caractéristiques de sobriété et d'élégance typiques de l'architecture de la Renaissance florentine.
Autour du cloître se trouvent les salles dans lesquelles se déroulait la vie communautaire: la Salle du Beato Angelico, la salle du Chapitre, la salle du lavabo et le réfectoire. Le bâtiment fut enrichi par le cycle de fresques peint par Beato Angelico qui y vécut et travailla dans la première moitié du XVe siècle et qui décora les cellules (où l’on trouve l'Annonciation et les Histoires de la vie de Jésus), les couloirs, le cloître et la salle du Chapitre; l'un des deux réfectoires fut peint à fresque par Domenico Ghirlandaio. De nombreuses peintures sur bois d'Angelico sont exposées dans la salle qui lui est dédiée.
Au premier étage du musée les visiteurs peuvent aussi admirer la bibliothèque monumentale, de Michelozzo.
Museo di San Marco
Piazza San Marco, 3, 50121 Firenze FI, Italia
Le trottoir n'étant pas abaissé au niveau de la route, l’accès est difficile. Il y a une marche à descendre au niveau de la porte d'entrée, franchissable avec une passerelle amovible (à demander au personnel).
L'intérieur est accessible: plateforme élévatrice pour rejoindre le 1er étage (mesures conformes aux normes) et une série de passerelles entre les salles. Les toilettes pour personnes handicapées se trouvent au rez-de-chaussée. La sortie n'est pas accessible en fauteuil roulant, il faut donc sortir par l'entrée.